После капитуляции Франции, Германией было захвачено в общей сложности 297 единиц S35, впоследствии принятых на вооружение Вермахта под обозначением Pz.Kpfw. S35 739 (f). Несмотря на свои недостатки, по своим боевым характеристикам S 35 являлся одним из лучших танков, имевшихся на тот момент в распоряжении Германии. Как и в случае с другими поставленными на вооружение вермахта иностранными танками, S35 подверглись небольшим переделкам. В частности, верхушка командирской башенки большинства танков была срезана и заменена двустворчатым люком, чтобы дать командиру лучший обзор. Также на танки зачастую устанавливалась стандартная для германских средних танков УКВ-радиостанция FuG 5 с передатчиком мощностью 5 Вт. На оборудованных радиостанцией танках в состав экипажа вводился отдельный заряжающий, размещавшийся на постоянном месте в башне. Кроме этого, часть S35 была переоборудована в командирские танки, на которые устанавливалась дополнительная радиостанция, на корме башни монтировалась рамочная антенна, а пушка заменялась деревянным макетом. Первые подразделения, укомплектованные Pz.Kpfw. S35 739 (f), были сформированы в конце 1940 — начале 1941 года. Это были 201-й и 202-й танковые полки, каждый из которых состоял из двух батальонов, включавших, в свою очередь, по три лёгкие роты. Кроме того, танками S 35 был укомплектован отдельный 301-й танковый батальон, позднее включённый в состав 202-го полка вместо его второго батальона, отправленного в Финляндию. Помимо подразделений, укомплектованных исключительно танками S35, формировались также смешанные подразделения со взводами танков Hotchkiss H35, в которых S35 выполняли функции командирских машин. В том или ином количестве, S 35 состояли на вооружении 100-го, 203-го и 204-го танковых полков, а также 202-го, 205-го, 206-го, 211-го, 212-го, 213-го, 214-го и 223-го отдельных танковых батальонов. Как и другая трофейная французская бронетехника, первоначально S35 использовались лишь на второстепенных направлениях и в антипартизанских операциях, в основном — на территории Югославии. Пятнадцать S35 использовались в составе бронепоездов № 26 — № 30, часть из которых применялась на советско-германском фронте. После значительных потерь, понесённых германскими бронетанковыми войсками в ходе операции «Барбаросса», S35 начали поступать на вооружение фронтовых танковых дивизий, выведенных в тыл во Францию для переоснащения. Кроме того, незначительное число снятых с S35 башен использовались в укреплениях «Атлантического вала» По состоянию на 1 июля 1943 года, в действующих частях насчитывалось 144 танка S35, из которых 67 находились во Франции, 43 — в Югославии, по 16 — в Норвегии и Финляндии и 2 — в составе группы армий «Центр». С октября 1943 года в частях, ведущих борьбу с партизанами на территории Югославии, S35, наравне с остальной трофейной французской бронетехникой, были в основном заменены захваченными итальянскими машинами, так что к 1944 году большинство S35 оказалось сосредоточено на территории Франции. Когда в июне 1944 года началась высадка союзных войск в Нормандии, на её отражение были брошены все имевшиеся силы, в том числе подразделения оккупационных сил во Франции и находившиеся на переформировании танковые дивизии, укомплектованные S35. Большинство S35 было при этом потеряно, однако отдельные танки ещё оставались в строю. Так, на 30 декабря 1944 года в действующих частях насчитывалось 12 машин этого типа, и даже на 26 марта 1945 года 5 из них всё ещё оставались в строю. По разным данным, от 40 до 70 танков S35 были переданы Германией своим союзникам. В частности, Италия запрашивала у Германии 50 S35 для отправки в Северную Африку, однако достоверно известно о доставке только 32 танков, причём без запаса запчастей. Батальон, вооружённый этими танками, перебросили в Сицилию, однако в итоге он был расформирован, так и не приняв участия в боях. Помимо этого, в 1943 году 6 или 7 танков были переданы Болгарии, однако уже в сентябре 1944 года они были возвращены немцам. Ещё два командирских S 35 в 1942 году были отправлены в Венгрию, по всей видимости, для использования вместе с полученными ею же от немцев H35 и H39. Наконец, по меньшей мере один S 35 был захвачен югославскими партизанами и использовался ими, будучи перевооружён британской 57-мм пушкой QF 6 pounder в увеличенной маске орудия.